Protein–RNA interactions for Protein: Q62247

Sox16, Protein SOX-16 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox16Q62247 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Hexim1-201ENSMUST00000053063 3495 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Gm28373-201ENSMUST00000178129 2724 ntTSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Psap-203ENSMUST00000165878 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Nup62-203ENSMUST00000207103 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Gm45011-201ENSMUST00000207620 2297 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Pcdhga3-201ENSMUST00000073447 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Gga3-201ENSMUST00000019135 3816 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Tmem251-201ENSMUST00000057416 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Shc1-203ENSMUST00000107417 3079 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Acin1-221ENSMUST00000150371 2494 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Morc4-202ENSMUST00000087401 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Mcf2l-203ENSMUST00000110866 5108 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Tbc1d17-201ENSMUST00000047085 8750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Kcna6-202ENSMUST00000112242 3464 ntAPPRIS P1 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Tlr9-201ENSMUST00000062241 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Dcaf10-204ENSMUST00000155551 7250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Gm18263-201ENSMUST00000220846 1928 ntBASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Diaph3-202ENSMUST00000168889 4582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Diaph3-201ENSMUST00000022599 4582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Sec62-201ENSMUST00000029256 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Gm36908-201ENSMUST00000218080 1662 ntTSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.75□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Spg11-201ENSMUST00000036450 7671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Gm19434-201ENSMUST00000204330 2573 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Arhgap4-203ENSMUST00000114405 6299 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Als2cl-203ENSMUST00000130386 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Epb41l1-203ENSMUST00000103136 6249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Ncor2-202ENSMUST00000086083 8575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Phrf1-201ENSMUST00000106027 5248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Cbx6-202ENSMUST00000109625 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Myo18a-205ENSMUST00000100794 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Lzts3-203ENSMUST00000110260 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Gm37785-201ENSMUST00000195783 2408 ntBASIC8.74□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Slc26a6-201ENSMUST00000098376 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Adam12-201ENSMUST00000067680 7675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.74□□□□□ -1.01
Sox16Q62247 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms