Protein–RNA interactions for Protein: Q62233

Six3, Homeobox protein SIX3, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Six3Q62233 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Six3Q62233 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Six3Q62233 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Six3Q62233 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Six3Q62233 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Six3Q62233 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Six3Q62233 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Six3Q62233 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Six3Q62233 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Six3Q62233 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six3Q62233 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Six3Q62233 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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