Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Sycp1Q62209 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sycp1Q62209 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms