Protein–RNA interactions for Protein: Q62186

Ssr4, Translocon-associated protein subunit delta, mousemouse

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Length 172 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssr4Q62186 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Polr2j-201ENSMUST00000041366 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Hrasls5-201ENSMUST00000025929 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Ssr4Q62186 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Ssr4Q62186 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
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