Protein–RNA interactions for Protein: Q62176

Rbm38, RNA-binding protein 38, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 237 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbm38Q62176 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Kcnd3-203ENSMUST00000118360 2668 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Pak4-201ENSMUST00000032823 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Slc7a15-201ENSMUST00000036938 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Tgm6-201ENSMUST00000028888 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Mcoln2-201ENSMUST00000011152 2520 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Hdgfl2-201ENSMUST00000002911 2264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Rusc1-201ENSMUST00000052539 3316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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Rbm38Q62176 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Cd3eap-201ENSMUST00000047036 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
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Rbm38Q62176 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Dlst-201ENSMUST00000053811 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Hdac11-201ENSMUST00000041736 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Zfp566-201ENSMUST00000088785 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Rbm38Q62176 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
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