Protein–RNA interactions for Protein: Q62029

Pabpc2, Polyadenylate-binding protein, mousemouse

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Length 628 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc2Q62029 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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Pabpc2Q62029 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pabpc2Q62029 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Pabpc2Q62029 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
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Pabpc2Q62029 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Pabpc2Q62029 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Pabpc2Q62029 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Pabpc2Q62029 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Pabpc2Q62029 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
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Pabpc2Q62029 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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Pabpc2Q62029 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pabpc2Q62029 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
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