Protein–RNA interactions for Protein: Q61999

Odf1, Outer dense fiber protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf1Q61999 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Odf1Q61999 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Odf1Q61999 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms