Protein–RNA interactions for Protein: Q61810

Ltbp3, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltbp3Q61810 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ltbp3Q61810 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ltbp3Q61810 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ltbp3Q61810 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ltbp3Q61810 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ltbp3Q61810 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms