Protein–RNA interactions for Protein: Q61739

Itga6, Integrin alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga6Q61739 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Itga6Q61739 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Itga6Q61739 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Itga6Q61739 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Itga6Q61739 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Itga6Q61739 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Itga6Q61739 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Itga6Q61739 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Itga6Q61739 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Itga6Q61739 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Itga6Q61739 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Itga6Q61739 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Itga6Q61739 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Itga6Q61739 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga6Q61739 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga6Q61739 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga6Q61739 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga6Q61739 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga6Q61739 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga6Q61739 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga6Q61739 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga6Q61739 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga6Q61739 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga6Q61739 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga6Q61739 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga6Q61739 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga6Q61739 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga6Q61739 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga6Q61739 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga6Q61739 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga6Q61739 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga6Q61739 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga6Q61739 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga6Q61739 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga6Q61739 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga6Q61739 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Itga6Q61739 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms