Protein–RNA interactions for Protein: Q61412

Vsx2, Visual system homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx2Q61412 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Vsx2Q61412 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vsx2Q61412 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms