Protein–RNA interactions for Protein: Q61285

Abcd2, ATP-binding cassette sub-family D member 2, mousemouse

Predictions only

Length 741 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd2Q61285 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Abcd2Q61285 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Abcd2Q61285 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms