Protein–RNA interactions for Protein: Q60987

Foxg1, Forkhead box protein G1, mousemouse

Predictions only

Length 481 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxg1Q60987 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
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Foxg1Q60987 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Foxg1Q60987 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms