Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rbbp4Q60972 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Rbbp4Q60972 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.3 ms