Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Neurod1Q60867 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Neurod1Q60867 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Neurod1Q60867 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Neurod1Q60867 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Neurod1Q60867 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Neurod1Q60867 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Neurod1Q60867 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Neurod1Q60867 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Neurod1Q60867 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Cpeb3-208ENSMUST00000132580 3148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Neurod1Q60867 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.9 ms