Protein–RNA interactions for Protein: Q60857

Slc6a4, Sodium-dependent serotonin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc6a4Q60857 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc6a4Q60857 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms