Protein–RNA interactions for Protein: Q60829

Ppp1r1b, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 1B, mousemouse

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r1bQ60829 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 A530058N18Rik-202ENSMUST00000134129 411 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Gstt4-202ENSMUST00000160211 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Blzf1-202ENSMUST00000086032 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Gm8515-201ENSMUST00000194852 576 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Gm31326-201ENSMUST00000191856 1048 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Mzt2-201ENSMUST00000023351 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Gm6180-201ENSMUST00000065243 498 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ppp1r1bQ60829 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms