Protein–RNA interactions for Protein: Q60772

Cdkn2c, Cyclin-dependent kinase 4 inhibitor C, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn2cQ60772 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Cdkn2cQ60772 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdkn2cQ60772 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdkn2cQ60772 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdkn2cQ60772 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdkn2cQ60772 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdkn2cQ60772 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdkn2cQ60772 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdkn2cQ60772 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Cdkn2cQ60772 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdkn2cQ60772 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdkn2cQ60772 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdkn2cQ60772 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdkn2cQ60772 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdkn2cQ60772 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdkn2cQ60772 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdkn2cQ60772 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdkn2cQ60772 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdkn2cQ60772 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Cdkn2cQ60772 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms