Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

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Length 1,040 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
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Tdrd5Q5VCS6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Tdrd5Q5VCS6 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Tdrd5Q5VCS6 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Tdrd5Q5VCS6 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Tdrd5Q5VCS6 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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Tdrd5Q5VCS6 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Tdrd5Q5VCS6 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Tdrd5Q5VCS6 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Tdrd5Q5VCS6 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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Tdrd5Q5VCS6 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Tdrd5Q5VCS6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.3 ms