Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXJ3

Brip1, Fanconi anemia group J protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,174 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brip1Q5SXJ3 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Brip1Q5SXJ3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Gm16976-201ENSMUST00000099718 1894 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Brip1Q5SXJ3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms