Protein–RNA interactions for Protein: Q5SV66

Ccdc42, Coiled-coil domain-containing protein 42, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc42Q5SV66 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc42Q5SV66 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc42Q5SV66 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms