Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE8

Ankrd40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd40Q5SUE8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Ankrd40Q5SUE8 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ankrd40Q5SUE8 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms