Protein–RNA interactions for Protein: Q5SNZ0

Ccdc88a, Girdin, mousemouse

Predictions only

Length 1,873 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88aQ5SNZ0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm11515-201ENSMUST00000150818 701 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Ccl25-205ENSMUST00000127460 867 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Ccdc88aQ5SNZ0 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 0610010K14Rik-205ENSMUST00000108575 643 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Pfdn5-205ENSMUST00000166658 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Ccdc88aQ5SNZ0 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms