Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJH3

Cdh12, Cadherin-12, mousemouse

Predictions only

Length 794 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh12Q5RJH3 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Cdh12Q5RJH3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cdh12Q5RJH3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 89.4 ms