Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCB3

Gm5431, Predicted gene 5431, mousemouse

Predictions only

Length 844 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5431Q5NCB3 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm5431Q5NCB3 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm5431Q5NCB3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms