Protein–RNA interactions for Protein: Q5KU39

Vps41, Vacuolar protein sorting-associated protein 41 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 853 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps41Q5KU39 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Vps41Q5KU39 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Vps41Q5KU39 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms