Protein–RNA interactions for Protein: Q5GH62

Xkr9, XK-related protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xkr9Q5GH62 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Xkr9Q5GH62 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Xkr9Q5GH62 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms