Protein–RNA interactions for Protein: Q5G5D5

Syna, Syncytin-A, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynaQ5G5D5 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SynaQ5G5D5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms