Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT4

Rtl5, Retrotransposon Gag-like protein 5, mousemouse

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Length 599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Rtl5Q5DTT4 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rtl5Q5DTT4 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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Rtl5Q5DTT4 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rtl5Q5DTT4 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rtl5Q5DTT4 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
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Rtl5Q5DTT4 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rtl5Q5DTT4 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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Rtl5Q5DTT4 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rtl5Q5DTT4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rtl5Q5DTT4 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rtl5Q5DTT4 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rtl5Q5DTT4 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rtl5Q5DTT4 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rtl5Q5DTT4 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
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