Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Znf354cQ571J5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Znf354cQ571J5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Znf354cQ571J5 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Znf354cQ571J5 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Znf354cQ571J5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354cQ571J5 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354cQ571J5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354cQ571J5 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354cQ571J5 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354cQ571J5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354cQ571J5 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354cQ571J5 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354cQ571J5 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354cQ571J5 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354cQ571J5 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354cQ571J5 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354cQ571J5 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354cQ571J5 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354cQ571J5 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354cQ571J5 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354cQ571J5 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354cQ571J5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354cQ571J5 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354cQ571J5 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354cQ571J5 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354cQ571J5 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354cQ571J5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354cQ571J5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354cQ571J5 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Znf354cQ571J5 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf354cQ571J5 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf354cQ571J5 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf354cQ571J5 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf354cQ571J5 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf354cQ571J5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf354cQ571J5 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf354cQ571J5 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Znf354cQ571J5 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms