Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 Gm15701-201ENSMUST00000129559 573 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 1700042O10Rik-201ENSMUST00000151032 1075 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 Il13-201ENSMUST00000020650 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 Sumo2-204ENSMUST00000118155 884 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 Rab33a-201ENSMUST00000033430 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Znf608Q56A10 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Rnaseh2a-206ENSMUST00000128972 1141 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Tpi-rs2-201ENSMUST00000182471 756 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Gm3436-201ENSMUST00000179930 840 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Coro6-205ENSMUST00000108391 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Znf608Q56A10 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms