Protein–RNA interactions for Protein: Q56A07

Scn2b, Sodium channel subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2bQ56A07 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Scn2bQ56A07 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms