Protein–RNA interactions for Protein: Q52KF3

Spire1, Protein spire homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spire1Q52KF3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Spire1Q52KF3 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms