Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp2Q504M2 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdp2Q504M2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdp2Q504M2 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Pdp2Q504M2 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Pdp2Q504M2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms