Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Ighv5-17-201ENSMUST00000103459 405 ntAPPRIS P1 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Ggt6-203ENSMUST00000108499 874 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Nudt17-201ENSMUST00000029742 1039 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Efhd1-201ENSMUST00000027472 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.55
Xirp2Q4U4S6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Xirp2Q4U4S6 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Xirp2Q4U4S6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Xirp2Q4U4S6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Xirp2Q4U4S6 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Xirp2Q4U4S6 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Xirp2Q4U4S6 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Xirp2Q4U4S6 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Xirp2Q4U4S6 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Xirp2Q4U4S6 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Xirp2Q4U4S6 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Xirp2Q4U4S6 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Xirp2Q4U4S6 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Xirp2Q4U4S6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Xirp2Q4U4S6 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Xirp2Q4U4S6 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Xirp2Q4U4S6 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Xirp2Q4U4S6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Xirp2Q4U4S6 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Xirp2Q4U4S6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Xirp2Q4U4S6 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Xirp2Q4U4S6 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
Xirp2Q4U4S6 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Xirp2Q4U4S6 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Xirp2Q4U4S6 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Xirp2Q4U4S6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Xirp2Q4U4S6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Xirp2Q4U4S6 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Xirp2Q4U4S6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Xirp2Q4U4S6 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
Xirp2Q4U4S6 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Xirp2Q4U4S6 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
Xirp2Q4U4S6 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Xirp2Q4U4S6 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.4 ms