Protein–RNA interactions for Protein: Q4TU90

Rhox3a, Reproductive homeobox 3A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhox3aQ4TU90 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rhox3aQ4TU90 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rhox3aQ4TU90 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms