Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL13

Gm527, Uncharacterized protein C14orf28 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm527Q4KL13 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm527Q4KL13 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm527Q4KL13 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm527Q4KL13 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm527Q4KL13 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm527Q4KL13 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm527Q4KL13 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm527Q4KL13 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm527Q4KL13 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm527Q4KL13 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm527Q4KL13 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Mir6990-201ENSMUST00000183724 91 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Gm527Q4KL13 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms