Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gm5935Q497S0 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gm5935Q497S0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Gm5935Q497S0 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Gm5935Q497S0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Gm5935Q497S0 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Gm5935Q497S0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Gm5935Q497S0 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Gm5935Q497S0 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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Gm5935Q497S0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm5935Q497S0 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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Gm5935Q497S0 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
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Gm5935Q497S0 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.8 ms