Protein–RNA interactions for Protein: Q497L1

H2al1n, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1nQ497L1 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Ncam2-201ENSMUST00000037785 4893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Tfe3-202ENSMUST00000079542 3163 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Palm2-202ENSMUST00000102905 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Iffo2-201ENSMUST00000040023 5227 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Fkbp4-201ENSMUST00000032508 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Phldb1-214ENSMUST00000147495 5424 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Szrd1-203ENSMUST00000102487 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Naa30-201ENSMUST00000037362 4464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Mob3c-201ENSMUST00000030477 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Pxdn-201ENSMUST00000118321 2698 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
H2al1nQ497L1 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms