Protein–RNA interactions for Protein: Q45KJ6

Lin28b, Protein lin-28 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28bQ45KJ6 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Lin28bQ45KJ6 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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