Protein–RNA interactions for Protein: Q3V129

Ulk4, Serine/threonine-protein kinase ULK4, mousemouse

Predictions only

Length 1,303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk4Q3V129 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Ulk4Q3V129 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.1 ms