Protein–RNA interactions for Protein: Q3V125

Ccdc110, Coiled-coil domain-containing protein 110, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc110Q3V125 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ccdc110Q3V125 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ccdc110Q3V125 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms