Protein–RNA interactions for Protein: Q3V038

Ttc9, Tetratricopeptide repeat protein 9A, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9Q3V038 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ttc9Q3V038 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ttc9Q3V038 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms