Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccdc160Q3UYG1 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Pde10a-202ENSMUST00000089085 7717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Nr2f2-201ENSMUST00000032768 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Tcf12-202ENSMUST00000183404 6299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Ntrk2-208ENSMUST00000225583 2719 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Rhoj-201ENSMUST00000055390 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Ppig-201ENSMUST00000040915 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Slco3a1-203ENSMUST00000107453 3793 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Peli3-202ENSMUST00000120475 2988 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccdc160Q3UYG1 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms