Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWX6

E330034G19Rik, RIKEN cDNA E330034G19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E330034G19RikQ3UWX6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
E330034G19RikQ3UWX6 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.7 ms