Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW68

Capn13, Calpain-13, mousemouse

Predictions only

Length 665 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn13Q3UW68 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Capn13Q3UW68 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Capn13Q3UW68 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms