Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chpf2Q3UU43 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chpf2Q3UU43 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Chpf2Q3UU43 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chpf2Q3UU43 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chpf2Q3UU43 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chpf2Q3UU43 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chpf2Q3UU43 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chpf2Q3UU43 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chpf2Q3UU43 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chpf2Q3UU43 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chpf2Q3UU43 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chpf2Q3UU43 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chpf2Q3UU43 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Chpf2Q3UU43 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chpf2Q3UU43 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chpf2Q3UU43 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chpf2Q3UU43 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chpf2Q3UU43 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chpf2Q3UU43 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Chpf2Q3UU43 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chpf2Q3UU43 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chpf2Q3UU43 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chpf2Q3UU43 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chpf2Q3UU43 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chpf2Q3UU43 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chpf2Q3UU43 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chpf2Q3UU43 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chpf2Q3UU43 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chpf2Q3UU43 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chpf2Q3UU43 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chpf2Q3UU43 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Chpf2Q3UU43 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chpf2Q3UU43 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chpf2Q3UU43 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Chpf2Q3UU43 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Chpf2Q3UU43 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms