Protein–RNA interactions for Protein: Q3UR97

Snx21, Sorting nexin-21, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx21Q3UR97 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Snx21Q3UR97 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Snx21Q3UR97 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms