Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ccdc33Q3ULW6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms