Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKJ7

Smu1, WD40 repeat-containing protein SMU1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 513 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smu1Q3UKJ7 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Smu1Q3UKJ7 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Smu1Q3UKJ7 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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