Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJK4

Gtpbp2, GTP-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp2Q3UJK4 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp2Q3UJK4 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp2Q3UJK4 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gtpbp2Q3UJK4 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp2Q3UJK4 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp2Q3UJK4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp2Q3UJK4 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp2Q3UJK4 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp2Q3UJK4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp2Q3UJK4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp2Q3UJK4 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp2Q3UJK4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp2Q3UJK4 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp2Q3UJK4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp2Q3UJK4 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp2Q3UJK4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp2Q3UJK4 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp2Q3UJK4 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp2Q3UJK4 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp2Q3UJK4 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp2Q3UJK4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp2Q3UJK4 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp2Q3UJK4 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp2Q3UJK4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp2Q3UJK4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp2Q3UJK4 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp2Q3UJK4 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp2Q3UJK4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp2Q3UJK4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gtpbp2Q3UJK4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gtpbp2Q3UJK4 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms